Charles blev gift med Isabella Graham Bethune Stewart den 30 dec. 1884. Isabella (datter af Dr Morse Stewart og Isabella Graham Duffield) blev født den 4 mar. 1857 i Michigan, USA; døde den 14 jul. 1927 i Ennis, Ellis, Texas, USA. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Isabella G B Lothrop blev født i feb. 1890 i Mississippi, USA; og døde.
2. George V Lothrop blev født i okt. 1885 i Michigan, USA; og døde.
3. Howard Lothrop blev født i okt. 1887 i Michigan, USA; døde den 21 nov. 1942 i Detroit, Wayne, Michigan, USA.
4. Mary S. Lothrop blev født i okt. 1891 i Michigan, USA; og døde.