Francis blev gift med Charlotte F. Brewster den 23 apr. 1854 i Bainbridge, Geauga, Ohio, USA. Charlotte (datter af Jesse Brewster og Ann Harpham) blev født den 20 dec. 1834 i Aubum, Geauga, Ohio, USA; døde den 27 nov. 1888 i Rives Township, Jackson, Michigan, United States; blev begravet i East Rives Cemetery, Rives Township, Jackson, Michigan, United States. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Clayton B. Henry blev født den 15 jan. 1855 i Bainbridge, Geauga, Ohio, USA; døde i 1867 i Ottawa, Ottawa, Kansas, United States.
2. Francis Henry blev født i 1860 i Bainbridge, Geauga, Ohio, USA; døde i 1860.
3. John Milo Henry blev født i sep. 1862 i Clinton Co, Iowa; døde den 24 maj 1891 i Rives, Jackson, Michigan; blev begravet i East Rives Cemetery, Rives Township, Jackson, Michigan, United States.