John blev gift med Mary Tucker den 17 jun. 1756 i Glocester, Providence, Rhode Island, USA. Mary blev født den 27 jun. 1735 i Gloucester, Essex, Massachusetts, USA; døde i 1779 i Glocester, Providence, Rhode Island, USA. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Abigail Thornton blev født i 1767 i Glocester, Providence, Rhode Island, USA.
2. Steven Thornton blev født den 18 sep. 1790 i Acworth, Sullivan, New Hampshire, USA; døde den 16 feb. 1845 i Acworth, Sullivan, New Hampshire, USA.
3. Jonathan Thornton blev født den 25 dec. 1764 i Glocester, Providence, Rhode Island, USA; døde den 8 mar. 1847 i Norwich, Chenango, New York, USA.
4. Daniel Thornton blev født den 25 apr. 1762 i Glocester, Providence, Rhode Island, USA; døde den 7 mar. 1813 i Norwich, Chenango, New York, USA.
5. Jesse Thornton blev født den 1 jan. 1757 i Providence, Rhode Island, USA; døde den 22 maj 1824 i Fleming, Cayuga, New York, USA; blev begravet i maj 1824 i Fleming Rural Cemetery, Fleming, Cayuga, New York, USA.