John blev gift med Mary Loomis den 20 maj 1641 i Windsor, Hartford, Connecticut, USA. Mary (datter af Joseph Loomis, Senior og Mary White) blev født i 1620 i Braintree, Essex, England; døde den 19 aug. 1680 i Windsor, Hartford, Connecticut, USA. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Mary Skinner blev født den 1 dec. 1637 i Hartford, Hartford, Connecticut, USA; døde den 15 sep. 1690 i Hartford, Hartford, Connecticut, USA.
2. John Skinner blev født i 1641 i Hartford, Hartford, Connecticut, USA; døde den 15 sep. 1690 i Windsor, Hartford, Connecticut, USA.
3. Joseph Skinner blev født i 1643 i Hartford, Hartford, Connecticut, USA; døde den 31 maj 1724 i Windsor, Hartford, Connecticut, USA.